Galaksien välinen rauha on jälleen vaarassa, kun tunnettu superrikollinen Vendra Prog ja hänen veljensä Neftin koettavat ottaa vallan maailmasta hallitsemalla hirmuisia Nether-olioita. Sisarusten suunnitelma ei kuitenkaan mene ihan oppikirjan mukaisesti, joten Ratchet ja Clank passitetaan pysäyttämään pahiskaksikko.